超濾離心管的使用
注:本文引自“分子莊園”公眾號,略有修改。
超濾離心管是一種膜過(guò)濾設備,是用于分離液體中不同分子或粒子的裝置。它利用特殊的超濾膜,通過(guò)應用壓力將液體樣品推動(dòng)穿過(guò)膜,從而分離不同分子或粒子的大小,廣泛用于蛋白質(zhì)、DNA和生物分子的濃縮、純化和脫鹽。
一、超濾與微濾
1、微濾
微濾 (Microfiltration) 涉及利用微孔膜介質(zhì)去除溶液中尺寸為 0.1 μm 至 10.0 μm 的顆?;蛏矬w。而超濾膜的過(guò)濾范圍為0.01μm至0.1μm。
微濾膜廣泛應用于生物制藥行業(yè)中的預過(guò)濾和除菌過(guò)濾。 在細胞實(shí)驗中,微濾最常用于樣品和培養基的滅菌(0.1μm微濾膜可去除支原體)。
此外,在核酸和蛋白質(zhì)分析之前,使用微濾膜可以有效地從細胞裂解物中去除完整的細胞和細胞碎片。 此步驟對于確保下游應用中結果的準確性至關(guān)重要。 通過(guò)微濾,研究人員可以獲得純化的樣品,從而提高核酸和蛋白質(zhì)相關(guān)研究的靈敏度和特異性。
2、超濾
超濾 (Ultrafiltration) 也是一種膜過(guò)濾,通過(guò)壓力或濃度梯度等力使料液通過(guò)半透膜進(jìn)行分離。 超濾膜能夠截留尺寸范圍為1-1000kDa(MW)的分子,并允許鹽和水等小分子通過(guò)。
超濾是大分子脫鹽、濃縮最方便的方法,已經(jīng)在蛋白、抗體、病毒、核酸、囊泡等樣品制備中建立標準操作。與沉淀法相比,超濾法更為溫和,避免了可能導致生物大分子失活的相變。

水流的方向垂直于膜的表面,能最大限度的提高水通量,在壓力差的作用下,水和小于膜孔的顆?;蛭镔|(zhì)透過(guò)膜,大于膜孔的顆粒則被膜截留。死端過(guò)濾隨著(zhù)過(guò)濾時(shí)間的延長(cháng),被截留顆粒將在膜表面形成污染層,阻塞膜孔,使過(guò)濾阻力增加,在操作壓力不變的情況下,膜的過(guò)濾透過(guò)率將下降;而增加壓力則可能是膜破裂。因此,死端過(guò)濾只能間歇進(jìn)行,必須周期性地清除膜表面的污染物層或更換膜。又叫錯流過(guò)濾(cross flow filtration):水流的方向平行于膜的表面,可以大量減少污染物在表面的富集,因為水流會(huì )將其帶走,同時(shí)也減少了堵孔的概率,使膜的通量能夠保持,同時(shí),膜上面承受的壓力也更小,可以延長(cháng)膜的使用壽命。錯流過(guò)濾運行時(shí),水流在膜表面產(chǎn)生兩個(gè)分力,一個(gè)是垂直于膜面的法向力,使水分子透過(guò)膜面,另一種是平行于膜面的切向力,把膜面的截留物沖刷掉。因此,錯流過(guò)濾的濾膜表面不易產(chǎn)生濃差極化現象和結垢問(wèn)題,過(guò)濾透過(guò)率衰減較慢。錯流過(guò)濾的運行方式比較靈活,既可以間歇運行,又可以實(shí)現連續運行。

三、超濾離心管
超濾離心管是一種利用離心力驅動(dòng)中小體積溶液通過(guò)超濾膜,進(jìn)行快速濃縮、滲濾和緩沖液置換的裝置。 它由蓋子、過(guò)濾裝置和離心管組成。

中間的過(guò)濾裝置既可用于滲透樣品,也可以用于保留樣品。當目標分子明顯小于濾膜孔徑時(shí),可使用超濾離心管對大分子污染物進(jìn)行除熱源、澄清和分離。目標樣品會(huì )透過(guò)濾膜并保留在離心管內。如果目標分子遠大于膜孔徑,則小分子污染物將被濾除,目標分子將集中在過(guò)濾裝置中。垂直設計的超濾膜具有更大的有效濾膜表面積,有助于快速的樣本處理,獲得較高的樣本回收率(通常>90%),并達到數十倍的濃縮,同時(shí)也最大程度降低了大顆?;虼蠓肿恿课镔|(zhì)堵塞濾膜。死體積設計能有效防止過(guò)度離心使樣本干掉而造成樣本損失。
收集濾出液后,濃縮樣本(截留部分)可通過(guò)一個(gè)簡(jiǎn)便的倒置(上下反轉)離心步驟而實(shí)現高效回收。反轉離心回收設計使蛋白樣品,特別是小體積樣品得到高效回收,避免槍頭吸取造成的樣品丟失或操作錯誤。

超濾管采用切向流過(guò)濾技術(shù),是一種以篩分為分離原理,以壓力為推動(dòng)力的膜分離過(guò)程。用于截留水中顆粒和大分子物質(zhì),而水和小分子物質(zhì)則允許透過(guò)膜,過(guò)濾精度在0.001-0.01μm(分子量1kD-1000kD)范圍內,可有效除去有機溶劑或者小分子物質(zhì),相反,也可以截留水中的微粒、膠體、細菌、熱源及高分子聚合物。選擇超濾離心管需要考慮樣品起始量以及超濾膜的截留分子量(MWCO)。影響截留和產(chǎn)物回收率的因素有很多,如分子構象、帶電特性、樣品濃度、操作條件等。而且超濾管上的截留分子量只是平均孔徑,實(shí)際孔徑是在左右正太分布的。
一般建議選擇截留分子量要比要濃縮的目標大分子的分子量小2-3倍的超濾膜,然后根據要處理的樣品體積選擇不同尺寸的超濾離心管。

為防超濾膜干裂和長(cháng)菌,通常超濾離心管內會(huì )附帶少量甘油和疊氮化鈉用于保護和儲存,在使用前需潤洗去除。一般是向超濾裝置中加入純水、去離子水或緩沖溶液,離心使溶液完全過(guò)膜,然后離心管中的所有液體。如果干擾仍然存在,可用0.1 M NaOH清洗,再用20%的乙醇清洗,最后用緩沖液或超純水水清洗并甩干。超濾膜一旦潤濕后就需保持濕潤避免變干直至使用結束,如果預清洗后沒(méi)有立即使用,可用20%的乙醇浸泡保存,務(wù)必保持濾膜潤濕,防止長(cháng)菌。
5、超濾管的放置
超濾管在離心機中的擺放需要符合切向流過(guò)濾要求,即水流方向與膜面平行。
1)水平轉子
使用水平轉子時(shí)放置沒(méi)有特殊要求。
水平轉子又稱(chēng)甩平轉子、蕩平轉子,轉頭靜止時(shí),處于轉頭中的離心管中心線(xiàn)與旋轉軸平行,轉頭旋轉加速時(shí),離心管中心線(xiàn)由平行位置逐漸過(guò)渡到垂直位置,即與旋轉軸成90?角。此種轉子主要用于樣品做密度梯度離心,顆粒移動(dòng)距離長(cháng),相應離心時(shí)間一般也較長(cháng),溶液中的組分相對于管壁的位置在離心過(guò)程中和離心后不發(fā)生改變,因此離心效果好,能夠分離密度差小的樣品。

2)固定角轉子
使用角轉子時(shí),雙面垂直膜超濾管放置方式要求濾膜側向相對。

單面垂直膜要求濾膜膜面朝下,這樣濾膜才能發(fā)揮切向流的作用。
有尖角的超濾管應使尖角朝上以便樣品進(jìn)入尖角,讓樣品收集更加方便,此外,死體積設計能有效防止過(guò)度離心使樣本干掉而造成樣本損失。固定角轉子中離心管與轉子的轉軸之間有一定的角度,角度變化范圍通常在14?-45?。此種轉子重心低,壽命長(cháng),容量較大,轉速較高,能承受的最大離心力可達800000g,主要用于分離沉降速度有明顯差異的顆粒樣品。顆粒在扇形溶液移動(dòng)的距離很短,碰到外壁的顆粒沿著(zhù)管壁滑到管底,形成沉淀,因此這種轉子能很快地收集沉淀物。
6、超濾管的截留分子量和膜孔徑關(guān)系
超濾管是一種膜過(guò)濾設備,用于分離液體中不同分子或粒子的裝置。它利用特殊的超濾膜,通過(guò)應用壓力將液體樣品推動(dòng)穿過(guò)膜,從而分離不同分子或粒子的大小。這種分離過(guò)程基于分子截留量,也就是膜的孔徑大小,決定了哪些分子可以通過(guò)膜,哪些分子被截留在膜上。
分子截留量是表示超濾膜的選擇性的重要參數,通常以道爾頓(Da)為單位,分子截留率表示膜可以截留的最大分子或粒子的大小。具體來(lái)說(shuō),如果膜的分子截留率是10kD,則該膜能夠截留分子量小于或等于10000的分子,而分子量大于10000的分子將被截留在膜上。
道爾頓是用來(lái)表示分子質(zhì)量或原子質(zhì)量的單位,一個(gè)分子的道爾頓數值大約等于其相對原子質(zhì)量或相對分子質(zhì)量。
截留分子量和孔徑之間的關(guān)系是復雜的。通常超濾膜的截留分子量是指在一定條件下,某些分子量的物質(zhì)被膜截留,被截住物質(zhì)的最小分子量即為膜的截留分子量,用以表征膜的分離能力;而孔徑則是反映膜的通透性的重要參數。分子量通常用單位為Dalton(Da)表示,而孔徑大小通常用單位為納米(nm)表示。
超濾膜截留的分子量10000、30000、50000 60000、100000、200000、300000、500000、1000000,對應超濾膜孔徑(μm) 0.01、0.02、0.03、0.04、0.05、0.06、0.07、0.08、0.1。也就是說(shuō)100kd(10萬(wàn))的截留分子量對應50nm的孔徑。
從數據上看,似乎存在一種對應關(guān)系,如超濾膜截留分子量為100kD(10萬(wàn))時(shí),對應的孔徑為0.05μm。但這種關(guān)系并不完全準確。因為超濾膜的孔徑和分子量的關(guān)聯(lián)并非簡(jiǎn)單的線(xiàn)性關(guān)系,對于具體的過(guò)濾器或分離膜,其材料、制備方法、孔徑大小分布等因素都會(huì )影響它們之間的關(guān)系。

7、超濾管的離心
超濾管如果離心轉速過(guò)高,可能會(huì )導致膜甚至管子的破裂,做實(shí)驗時(shí)要根據不同品牌超濾管的說(shuō)明書(shū)中明確指出的最大轉速和離心力,調整離心轉速到超濾管的承受范圍內。
離心機的轉速與離心機的半徑以及離心力都有關(guān)系,不同半徑的離心機,相同轉速出來(lái)的離心力也不一樣。離心力g和rpm(轉/min)轉換公式:g=r×11.8×10??×rpm2,其中g(shù)有時(shí)用相對離心力(RCF)表示。
r 為有效離心半徑,即從離心機軸心到離心管底的長(cháng)度,單位為厘米(cm)。
8、超濾管使用建議
1)超濾管不能進(jìn)行高壓滅菌,可使用70%乙醇或環(huán)氧乙烷滅菌。
2)超濾管一般不建議重復使用超過(guò)5次。受到樣品性質(zhì)的影響,先用0.1M的NaOH浸泡1-2h,然后用20%乙醇清洗,最后用超純水或緩沖液清洗3次,即可再用。
3、如果樣品是線(xiàn)性蛋白,需使用較低的離心速度和時(shí)間避免蛋白降解。
4、濃縮過(guò)快或者過(guò)度濃縮可能會(huì )引起蛋白沉淀。建議蛋白濃縮后最終濃度不超過(guò)20mg/ml,同時(shí)降低離心速度并改用截留分子量更大的超濾管。
建議的改進(jìn)方法是:①離心力降為推薦離心力的30%-50%;②改用截留分子量大的超濾管(如原本選用10kD,此時(shí)可以選擇30kD);③取出超濾管, 用吸頭反復吹吸幾次后再繼續濃縮。
6、過(guò)濾速率受到超濾管MWCO,樣品濃度,粘度,離心力和溫度的影響。如果樣品中固體含量超過(guò)5%,離心時(shí)間需要增加。當在4℃下運行時(shí),流速大約比25℃時(shí)慢1.5倍。粘性溶液(如50%甘油)的濃縮時(shí)間大概是常規溶液的5倍。
7、如果要用超濾的方法分離兩種蛋白,按照經(jīng)驗,兩個(gè)蛋白的分子量要相差一個(gè)數量級(10 倍)。
8、擔心濃縮過(guò)程中目的蛋白和超濾膜之間可能存在非特異性吸附,可嘗試以下操作:①確保蛋白濃度不要過(guò)低;②盡量選用纖維素的低吸附超濾;③選用小體積超濾管,通過(guò)減小膜面積來(lái)降低非特異性吸附;④使用前可以先對膜進(jìn)行封閉:1%脫脂奶粉,1%BSA,5%Tween 20,5%SDS,5%TritonX-100,5%PEG3000(不影響蛋白活性,不影響蛋白后續使用的前提下)。
9、對于有些樣品含量非常少的情況,可嘗試一下操作:①盡量選擇較小的截留分子量的超濾管;②選擇帶有尖角收集器的超濾管以便最大限度回收樣品;③使用水平轉子優(yōu)于角轉子;④濃縮完用緩沖液清洗多次回收, 注意移液器的槍頭不要碰到膜,以免膜破裂;⑤使用前可以先對膜進(jìn)行封閉。